Pohjois-Pohjanmaan ely-keskuksen asiantuntijoiden toteuttama Oulujoen–Iijoen vesienhoitoalueen toimenpideohjelma vuosille 2022–2027 on valmistunut.
Siikajoen vesistöalue kuuluu suunnittelualueeseen, joka ulottuu Kalajoen vesistöalueelta Temmesjoen vesistöalueelle.
Siikajoen vesistöalueella on luokiteltu 22 järvi- ja 20 virtavesimuodostumaa. Vesistöjen tilaa on verrattu vuoden 2013 tietojen perusteella vuosina 2012-2017 kerättyihin tietoihin.
Järvistä 15 ja virtavesistä kolme on hyvässä ekologisessa tilassa. Virtavesistä tämän maininnan saivat Eteläjoki Mulkua, Kärsämänoja ja Pyhännänjoki.